No que diz respeito aos comandos e procedimentos para manipulação e gerenciamento do sistema de arquivos dos Sistemas Operacionais, o Linux utiliza diretórios com diversas finalidades. Dentre eles, um armazena os módulos do kernel e as bibliotecas para os comandos /bin e /sbin e o outro, armazena arquivos de configuração e scripts de inicialização.
Esses dois diretórios são conhecidos, respectivamente, por: